پونی هافلینگر اتریشی نام خود را از روستای هافلینگ در منطقه تیرول جنوبی که اولین بار صدسال قبل در آن پرورش‌یافته گرفته است.
اجداد این پونی اسب‌های بومی مناطق کوهستانی بودند که به‌وسیله آمیزش با اسب عربی اصلاح شدند. اجداد تمام اسب‌های هافلینگر امروزی اسب‌های هیرید البداوی بیست‌ودو پسر البداوی بیست‌ودو و اسب فولی هستند.